Insgesamt gibt es 83 Crypto-Pokémon. Im normalen Spielverlauf kannst du 82 fangen. Das 83. Crypto-Pokémon, Dragoran, findest du nach dem normalen Spielverlauf auf dem Leuchtturm in Portaportus.
Im folgenden Abschnitt findest du eine Liste aller Crypto-Pokémon sowie ihrer Fundorte:
| Pokemon | Level | Fundort |
| Teddiursa | Lv. 11 | Pokémon Hauptlabor |
| Ledyba | Lv. 10 | Portaportus |
| Fiffyen | Lv. 10 | Portaportus |
| Hunduster | Lv. 17 | Crypto-Labor |
| Puppance | Lv. 17 | Crypto-Labor |
| Seemops | Lv. 17 | Crypto-Labor |
| Voltilamm | Lv. 17 | Crypto-Labor |
| Schluppuck | Lv. 17 | Crypto-Labor |
| Samurzel | Lv. 17 | Crypto-Labor |
| Webarak | Lv. 14 | Crypto-Labor |
| Camaub | Lv. 14 | Crypto-Labor |
| Knilz | Lv. 15 | Crypto-Labor |
| Kanivanha | Lv. 15 | Crypto-Labor |
| Enekoro | Lv. 18 | Crypto-Labor |
| Voltobal | Lv. 19 | Höhlen-Platz |
| Makuhita | Lv. 18 | ONBS Station |
| Vulpix | Lv. 18 | ONBS Station |
| Zwirrlicht | Lv. 19 | ONBS Station |
| Trasla | Lv. 20 | ONBS Station |
| Flunkifer | Lv. 22 | ONBS Station |
| Schneppke | Lv. 20 | Phenac Bürgermeister |
| Tannza | Lv. 20 | Phenac Bürgermeister |
| Natu | Lv. 22 | Phenac Arena |
| Roselia | Lv. 22 | Phenac Arena |
| Mauzi | Lv. 22 | Phenac Arena |
| Quiekel | Lv. 22 | Phenac Stadion |
| Habitak | Lv. 22 | Phenac Stadion |
| Sleima | Lv. 23 | Phenac Stadion |
| Jurob | Lv. 23 | Phenac Stadion |
| Lunastein | Lv. 25 | Phenac Stadion |
| Togepi | Lv. 25 | Wüstenbar |
| Nasgnet | Lv. 26 | Phenac Stadion |
| Sengo | Lv. 28 | Crypto-Festung |
| Paras | Lv. 28 | Crypto-Festung |
| Fukano | Lv. 28 | Crypto-Festung |
| Muschas | Lv. 39 | Crypto-Festung |
| Bibor | Lv. 30 | Crypto-Festung |
| Tauboga | Lv. 30 | Crypto-Festung |
| Tangela | Lv. 30 | Crypto-Festung |
| Smettbo | Lv. 30 | Crypto-Festung |
| Magneton | Lv. 30 | Crypto-Festung |
| Omot | Lv. 32 | Crypto-Festung |
| Ultrigaria | Lv. 32 | Crypto-Festung |
| Arbok | Lv. 33 | Crypto-Festung |
| Rasaff | Lv. 34 | Crypto-Festung |
| Hypno | Lv. 34 | Crypto-Festung |
| Entoron | Lv. 33 | Insel Obscura |
| Zobiris | Lv. 33 | Insel Obscura |
| Rattikarl | Lv. 34 | Insel Obscura |
| Dodri | Lv. 34 | Insel Obscura |
| Porenta | Lv. 36 | Insel Obscura |
| Altaria | Lv. 36 | Insel Obscura |
| Kangama | Lv. 35 | Insel Obscura |
| Banette | Lv. 35 | Insel Obscura |
| Magmar | Lv. 36 | Insel Obscura |
| Pinsir | Lv. 35 | Insel Obscura |
| Magcargo | Lv. 38 | Insel Obscura |
| Gallopa | Lv. 40 | Insel Obscura |
| Kicklee | Lv. 38 | Insel Obscura |
| Nockchan | Lv. 38 | Insel Obscura |
| Schlurp | Lv. 38 | Insel Obscura |
| Sichlor | Lv. 40 | Insel Obscura |
| Chaneira | Lv. 39 | Insel Obscura |
| Sonnfel | Lv. 41 | Insel Obscura |
| Starmie | Lv. 41 | Insel Obscura |
| Schwalboss | Lv. 43 | Insel Obscura |
| Elektek | Lv. 43 | Insel Obscura |
| Relaxo | Lv. 43 | Insel Obscura |
| Quappo | Lv. 43 | Insel Obscura |
| Pantimos | Lv. 43 | Insel Obscura |
| Digdri | Lv. 40 | Insel Obscura |
| Voltenso | Lv. 44 | Insel Obscura |
| Brutalanda | Lv. 50 | Insel Obscura |
| Knogga | Lv. 44 | Insel Obscura |
| Lapras | Lv. 44 | Insel Obscura |
| Lugia | Lv. 50 | Insel Obscura |
| Arktos | Lv. 50 | Insel Obscura |
| Zapdos | Lv. 50 | Insel Obscura |
| Lavados | Lv. 50 | Insel Obscura |
| Tauros | Lv. 46 | Insel Obscura |
| Rizeros | Lv. 46 | Insel Obscura |
| Kokowei | Lv. 46 | Insel Obscura |
| Dragoran | Lv. 50 | Portaportus |