In der Smagragd-Edition ist es das erste Mal möglich, beide Fossilien zu erhalten. Das erste findest du diesmal nicht einfach in der Wüste, wie in der Rubin- bzw. Saphir-Edition, sondern im so genannten Wunderturm. Dieser befindet sich gleich beim südlichen Eingang der Wüste, welchen man von Malvenfroh City aus problemlos erreichen kann. Um in den Wunderturm zu gelangen brauchst du vier Sachen: das Eilrad, die VM06 Zertrümmerer, das Wüstenglas und ein bisschen Glück.
Sowohl das Eilrad als auch die VM06 findest du in Malvenfroh City. Das Wüstenglas erhälst du von deinem Rivalen, sobald du die vierte Arenaleiterin, Flavia, besiegt hast und du die Arena verlässt.
Du siehst den Wunderturm ohne größere Probleme, sobald er auftaucht. Das ist jedoch Glückssache. Sollte er einmal erschienen sein, musst du lediglich einen Stock mit dem Eilrad überwinden und zweimal den Zertrümmerer einsetzen. Jetzt hast du jedoch die Qual der Wahl: Wählst du das antike Fossil von Anorith oder doch das von Liliep?